Introduction d'un bouton de course, des combos, des codes en versus, des animalités, toujours des fatalités de stage et un perso caché.

L'esprit de la reine Sindel renaît sur Terre en créant une porte dimensionnelle vers l'Outworld : Shao Kahn peut réclamer toutes les âmes.

Motaro le centaure est dur (sauts, boule d'énergie, téléportation), Shao Kahn l'empereur est rapide et puissant (flèche, marteau, charges).

Le jeu propose 3 destinées plus ou moins longues et difficiles, les endurances ont disparu et les codes au game over activent des bonus.